Im Dreißigjährigen Krieg zünden 1640 einquartierte französische Soldaten durch leichtfertigen Umgang mit Feuer die halbe Stadt an
Das Rathaus mit dem Ratsarchiv wird ein Raub der Flammen
1684-1687 wird das heutige Rathaus mit dem Turm erbaut. Es dient als Bürgermeisteramt, Polizeistation, Gefängnis, Gerichtsort und beherbergt die Gaststätte Ratskeller
Mit der Eingemeindung der Stadt Lobeda 1946 nach Jena verliert das Rathaus seine historische Funktion
Seit 2012 wird das Rathaus saniert